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智能摘要
SnapGene mac版是一款极为强大的分子生物学软件。它模拟了Clontech的In - Fusion克隆技术，用户只需选定想要融合的DNA片段，就能设计引物，是创建无缝基因融合的通用方法。该软件还简化了吉布森装配反应计划，自动化底漆设计，通过PCR扩增待连接DNA片段以产生重叠末端。同时，它能直观地进行注释分析和绘制DNA图谱，创建和共享丰富的注释文件，助力分子生物学图形绘制。
此外，SnapGene软件方便教师和专业学生分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒元件，可将数据导出为与其他流行DNA序列软件兼容的文件格式。它还提供了规划、可视化和记录DNA克隆与PCR的简便方法，用户能轻松注释功能并设计引物，生成详细的DNA序列文件并与同事共享，有需求的朋友可下载使用。
功能介绍
一、想象
1、DNA可视化：可查看DNA序列的多个视图，如地图、序列、酶、特征、引物、历史等。能自定义酶位点、特征、引物、ORF、DNA颜色等的显示，地图支持圆形或线性格式。
2、大序列支持：能浏览染色体大小序列，可进行查看、搜索、缩放操作，利用高效数据处理功能扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
3、蛋白质可视化：可查看蛋白质序列的多个视图，包括地图、序列、属性、特征、历史等，能自定义区域、站点、键和序列颜色的显示。
4、直观的序列编辑：轻松编辑DNA和蛋白质序列，可进行插入、删除、替换和大小写更改，复制粘贴序列时自动传输功能。
5、序列颜色编码：可将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一，能给两条DNA链或蛋白质序列着色，颜色在地图和序列视图中均可见。
6、特征注释：可自动注释常用功能，也能手动注释新功能，利用广泛数据库查找DNA序列中的常见特征，还可将其他功能添加到自定义数据库。
二、模拟
1、限制性站点指标：确认限制性网站是否适合克隆，以粗体显示独特的限制性位点，或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6 + Cutters酶组。
2、限制性克隆：可视化克隆过程的各个方面，若已考虑好过程，模拟只需几秒，若存在设计缺陷可捕获并纠正错误。
3、PCR：模拟标准PCR，可使用自己的引物，也可让软件自动设计引物，产品文件在历史记录中存储模板和引物。
4、重叠延伸PCR：通过重叠延伸PCR融合片段，最多可组装八个片段，选择要连接的片段及其方向，软件将设计引物。
5、引物定向诱变：使用诱变引物进行定点诱变，选择诱变引物后按下按钮可查看修饰的质粒，历史颜色突出突变。
6、网关®克隆：模拟网关® BP克隆或lr克隆，或两者同时进行，提供常见的供体向量和目的向量，选择要组装的片段，软件将设计引物。
7、吉布森大会®：通过融合多达八个片段或插入多达八个片段到向量来模拟Gibson Assembly，这是一种流行的无缝克隆方法，选择要融合的片段及其方向，软件将设计引物，线性化的载体可通过酶消化或反向PCR产生。
8、IN - FUSION ®克隆：通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In - Fusion克隆，用于创建无缝基因融合，选择要融合的片段及其方向，软件将设计引物，线性化的载体可通过酶消化或反向PCR产生。
9、TA和GC克隆：通过TA或GC克隆捕获PCR产物，可选择传统的TA克隆或高效GC克隆，提供常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
10、退火Oligos：退火两个寡核苷酸形成双链产物，使用简单控件添加突出限制克隆。
三、避免错误
1、阅读基因融合的框架：确保构造中的已转换要素符合框架，使用“序列”视图可快速查看两个已翻译的要素是否在框架中，若在则翻译链接在同一行，否则在单独行。
2、与参考序列对齐：使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
四、自动录制
1、全面的“撤销”能力：几乎可撤销任何操作，使用软件文件时无需担心，回溯步骤简单。
2、历史和嵌入式祖先：查看构造的图形历史记录，单击操作可突出显示亲本和产物序列的相关部分，单击PCR引物名称可查看引物序列，单击历史记录树中的祖先可重新生成该祖先序列文件，包括其注释和克隆历史记录。
3、历史色彩：使用可选的历史记录颜色标识序列的最新更改，详细了解构建体的组装方式，包括结扎的粘性末端。
五、有你的数据
1、安全文件管理：可将软件文件保存在所需位置，使用熟悉的安全操作系统存储和整理文件。
2、从其他格式导入：能读取许多常见的文件格式，不仅导入DNA序列，还导入注释和注释，持续开发进口商以避免被锁定为专有文件格式。
3、导出为标准格式：将序列、地图或凝胶图像转换为标准格式，以便与其他软件一起使用，如将序列导出为GenBank或FASTA格式，将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
4、使用SnapGene Viewer共享数据：将软件格式的文件发送给可下载免费SnapGene Viewer的同事或客户，只需将文件与链接一起发送，收件人能看到地图、序列和注释，如同在完整软件界面中。
六、转换文件格式
开放式信息交换至关重要，因此软件和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。
软件特色
1、设计更好的程序：准确设计和模拟克隆程序，测试复杂项目，在错误发生前发现错误，确保首次获得正确构造。
2、可视化您的流程：直观的界面让克隆操作更轻松，提供无与伦比的工作可见性，简化复杂任务。
3、自动记录您的工作：软件自动记录文档，用户无需手动操作，可查看并分享导致最终质粒的每个序列编辑和克隆程序。
